Sul territorio nazionale, ENUIP dispone di 2 sedi distribuite sul territorio nazionale che hanno la funzione di erogare i servizi formativi, diffondere la cultura dell'innovazione nel mercato del lavoro, promuovere l'orientamento professionale e l'inserimento lavorativo, rilevare i fabbisogni formativi.
    La Sede Enuip Sicilia è provvista dell’accreditamento presso la Regione. Gli uffici della sede nazionale di Roma sono preposti alle attività coordinamento, progettazione, studio, ricerca, valutazione e monitoraggio.

    L’Ente si configura, dunque, come unico soggetto giuridico pur organizzato nella forma di sistema associativo a rete, costituito dalla sede nazionale, dalle sedi regionali e dalle eventuali sedi estere. La logica del network consente la condivisione delle esperienze formative e degli strumenti di supporto come anche la razionalizzazione della gestione, attraverso la realizzazione di opportune economie di scala.